Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP3P42574 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP3P42574 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP3P42574 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP3P42574 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP3P42574 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP3P42574 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP3P42574 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP3P42574 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms