Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MLH1P40692 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLH1P40692 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLH1P40692 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLH1P40692 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLH1P40692 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLH1P40692 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLH1P40692 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLH1P40692 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms