Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA6P31267 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms