Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms