Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSPP15924 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSPP15924 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSPP15924 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSPP15924 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms