Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL2P13500 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL2P13500 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL2P13500 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL2P13500 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms