Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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UBL4AP11441 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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UBL4AP11441 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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UBL4AP11441 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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UBL4AP11441 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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