Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSLP07711 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSLP07711 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSLP07711 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms