Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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