Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms