Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLGNO14967 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLGNO14967 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLGNO14967 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLGNO14967 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLGNO14967 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLGNO14967 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLGNO14967 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLGNO14967 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms