Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3C2AO00443 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms