Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms