Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms