Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NL46 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NL46 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NL46 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NL46 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NL46 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NL46 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A6NL46 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NL46 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NL46 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NL46 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NL46 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NL46 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NL46 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NL46 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms