Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms