Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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