Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXND1Q9Y4D7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXND1Q9Y4D7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms