Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms