Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms