Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms