Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms