Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD5Q9P267 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms