Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms