Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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LHX9Q9NQ69 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LHX9Q9NQ69 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LHX9Q9NQ69 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LHX9Q9NQ69 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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