Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms