Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SMIM3Q9BZL3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM3Q9BZL3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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