Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF12Q99081 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCF12Q99081 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms