Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX18Q96RF0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms