Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPALINQ96PE5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPALINQ96PE5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms