Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms