Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms