Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms