Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP3Q8WYN3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms