Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms