Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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