Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPC24Q8NBT2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPC24Q8NBT2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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