Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF1Q8N6C5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF1Q8N6C5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms