Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR88Q6ZMY6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms