Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL17Q6UXB2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.7 ms