Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXO42Q6P3S6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXO42Q6P3S6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms