Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms