Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms