Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms