Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms