Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms