Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HADHQ16836 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HADHQ16836 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HADHQ16836 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms