Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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