Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms