Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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VPS72Q15906 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS72Q15906 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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